Антон, вы всё правильно показали.

Остаётся добавить, что подобный педантизм стоит приберечь для «сайтов-музеев». Живые сервисные сайты легко переживут без висячей пунктуации.

Комментарии

Всё просто: если подчёркнутой оказалась кавычка с одной стороны, то её обязательно нужно подчёркнуть и с другой.

А настолько ли необходимы вообще фразы-ссылки? Какой-то дурной тон видится в этом. Ведь целиком подчёркнутые и выделенные цветом фразы и, тем более, абзацы весьма неудобно читать. Жаль, что Чихольд не дожил до появления интернета, он бы наверняка веско заклеймил такую практику ;)

С другой стороны, во втором примере с первого взгляда понятно, что перейдя по ссылке, я найду ответ на вопрос «Почему», а не текст «Капитанской дочки».

В данном случае, возможно, было бы уместно сделать ссылкой одно только слово «почему».

Универсального метода нет, всегда надо смотреть на контекст использования. Далеко не редки ситуации, когда скорость доступа к ссылке (вспоминаем закон Фиттса) важнее эстетики. Представьте, если бы поисковые системы начали бы в результатах поиска подчеркивать не заголовок страницы, а только его часть или, скажем, часть текста (сниппета). Ужас был бы невероятный.